El Comité Nacional Pro Defensa de la Flora y Fauna nace el 23 de Octubre de 1968, cuando un grupo de visionarios académicos, investigadores y otros profesionales que compartían el amor por la naturaleza, deciden formar un grupo de trabajo, o Comité, con el fin de atraer y convocar la colaboración ciudadana y privada a los esfuerzos de conservación, asumiendo que el Estado por sísólo no podía dar respuesta a todas las demandas y problemáticas ambientales. La finalidad de CODEFF era diferenciarse de las asociaciones meramente científicas y compuestas por profesionales, para abrir la participación a aficionados, estudiantes, mujeres y niños.
Reconociendo participación de muchos profesionales, lo cierto es que el liderazgo motor yclave corresponde a don Godofredo Stutzin, abogado, hijo de inmigrantes alemanes, quién durante los años 60 comienza a difundir una voz de alarma y a promover soluciones para la explotación irracional de nuestra flora, fauna, y otros recursos naturales. Forman parte también del grupo fundador Alfredo Johnson, Luis Peña, JürgenRottman, Francisco Fuchslocher, Jack Goodall, Guillermo Egli, Guillermo Mann, Víctor Solar, Hernán Contreras Manfredi, Rafael Elizalde Mc Clure, Jorge Nawrath, Klaus Busse, Daniel Torres, Juan Grau Roberto Schlater, Luis Capurro,PabloWeisser, HectorCathalifaud, Carlos Muñoz y Fernando Hartwig; todos destacados profesionales, académicos e investigadores que han realizado grandes aportes al conocimiento y valoración de nuestro patrimonio natural.
El 26 de Junio de 1969 se publica en el diario oficial el Decreto Supremo que otorga personalidad jurídica a CODEFF. Pese al respaldo legal, no había oficinas ni ninguna infraestructura de trabajo. Sobre estos tiempos, Godofredo Stutzin recordaba en sus escritos:
"Cuando partimos no teníamos la seguridad de que en el tiempo nuestra idea pudiera consolidarse, como finalmente ha sucedido. Sólo sentíamos que era necesario hacer algo, lo deseábamos…soñábamos que sería así."
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